对Avro文件的支持
上级主题: 使用Hadoop分布式文件系统(HDFS)表
Avro文件把数据定义(模式)和数据本身一起存储在一个文件中,让程序便于动态地理解存储在Avro文件中的信息。Avro模式是JSON格式的,而数据是二进制格式,这让它很紧凑且高效。
下面的Avro模式的例子定义了一个有3个域的Avro记录:
- name
- favorite_number
- favorite_color
有两行基于该模式的数据:
{ "name" : "BlizzardCS" , "favorite_number" : 21 , "favorite_color" : "green" }
有关Avro文件格式的信息请见
对Avro文件格式的支持要求这些jar文件:
- avro-1.7.7.jar
- avro-tools-1.7.7.jar
- avro-mapred-1.7.5-hadoop2.jar(在Apache Pig中有)
注意: Hadoop 2发布包括了Avro的jar文件$HADOOP_HOME/share/hadoop/common/lib/avro-1.7.4.jar。为了避免冲突,可以把该文件重命名为另一个文件,例如avro-1.7.4.jar.bak。
对于Cloudera 5.4.x Hadoop 发布,只需要下载和安装jar文件avro-mapred-1.7.5-hadoop2.jar。该发布含有其他所需的jar文件。其他文件被包括在gphdfs协议所用的classpath中。
有关下载Avro的jar文件,请见https://avro.apache.org/releases.html。
在Greenplum数据库的所有主机上,确保这些jar文件被安装并且在gphdfs使用的classpath上。classpath由脚本$GPHOME/lib/hadoop/hadoop_env.sh指定。
作为一个例子,如果目录$HADOOP_HOME/share/hadoop/common/lib不存在,请作为gpadmin用户在Greenplum数据库的所有主机上创建它。然后,在所有的主机上把jar文件加到该目录中。
hadoop_env.sh脚本文件会把这些jar文件增加到gphdfs协议的classpath。该脚本文件中是这个片段负责这项工作:
if [ -d "${HADOOP_HOME}/share/hadoop/common/lib" ]; then
for f in ${HADOOP_HOME}/share/hadoop/common/lib/*.jar; do
CLASSPATH=${CLASSPATH}:$f;
done
Greenplum数据库的gphdfs协议支持Avro文件类型作为一个外部表:
- Avro文件格式 - GPDB认证了Avro 版本 1.7.7
- 读写Avro文件
- 读取Avro文件时支持覆盖Avro模式
- 在写入时压缩Avro文件
- 写Avro文件时自动生成Avro模式
如果Avro文件含有不被支持的特性或者指定的模式不匹配数据,Greenplum数据库会返回一个错误。
要从一个Avro文件读取或者向其中写入,需要创建一个外部表,并且在LOCATION子句中指定该Avro文件的位置以及在FORMAT子句中指定’AVRO’。例如,这是一个可读外部表的语法。
CREATE EXTERNAL TABLE tablename (column_spec) LOCATION ( 'gphdfs://location') FORMAT 'AVRO'
location可以是单个Avro文件或者一个含有一组Avro文件的目录。如果该位置指定多个文件(一个目录名或者一个含有通配符的文件名),Greenplum数据库使用该目录中第一个文件的模式作为整个目录的模式。在文件名中可以指定通配符 * 来匹配任意数量的字符。
在location中指定的文件后面可以增加参数。可以增加使用http查询字符串语法的参数,它开始于?并且用&分隔域/值对。
对于可读的外部表,唯一合法的参数是schema。在读取Avro文件时,gphdfs使用这个模式取代Avro文件中的模式。见。
这一组参数指定snappy压缩:
'compress=true&codec=snappy'
这两组参数指定deflate压缩并且等效:
读取Avro文件时的数据转换
在创建一个到Avro文件数据的可读外部表时,Greenplum数据库会把Avro数据类型转换成Greenplum数据库数据类型。
注意: 在读取一个Avro时,Greenplum数据库把Avro模式顶层的Avro域数据转换成一个Greenplum数据库表列。下面是gphdfs协议如何转换Avro数据类型的例子。
- 一种Avro简单数据类型,Greenplum数据库把数据转换成一种Greenplum数据库类型。
- 一种不是map或者record的Avro复杂数据类型,Greenplum数据库把数据转换成一种Greenplum数据库类型。
- 一种是子记录(内嵌在顶层Avro模式记录中)的Avro 记录,Greenplum数据库把数据转换成XML。
这个表格列举了Avro简单数据类型及转换成的Greenplum数据库类型。
注意: 在把Avro的int数据类型读取为Greenplum数据库的smallint数据类型时,必须确保Avro的int值不会超过Greenplum数据库的最大smallint值。如果Avro值太大,Greenplum数据库的值将不准确。
gphdfs协议会为smallint执行这样的转换:short result = (short)IntValue;。
这个表格列举了Avro的复杂数据类型及其转换成的Greenplum数据库类型。
Avro模式实例
这里是一个Avro模式的例子。在从该Avro文件读取数据时,gphdfs协议执行这些转换:
- name以及color数据被转换到Greenplum数据库的string。
- age数据被转换到Greenplum数据库的int。
- clist记录被转换到XML。
{"namespace": "example.avro",
"type": "record",
"name": "User",
"fields": [
{"name": "name", "type": "string"},
{"name": "color", "type": ["string", "null"]},
{"name": "clist",
"type": {
"type":"record",
"name":"clistRecord",
"fields":[
{"name": "class", "type": ["string", "null"]},
{"name": "score", "type": ["double", "null"]},
{"name": "grade",
"type": {
"type":"record",
"name":"inner2",
"fields":[
{"name":"a", "type":["double" ,"null"]},
{"name":"b", "type":["string","null"]}
]}
},
{"name": "grade2",
"type": {
"type":"record",
"name":"inner",
{"name":"a", "type":["double","null"]},
{"name":"b", "type":["string","null"]},
{"name":"c", "type":{
"type": "record",
"name":"inner3",
"fields":[
{"name":"c1", "type":["string", "null"]},
{"name":"c2", "type":["int", "null"]}
]}}
]}
}
]}
}
]
}
这个XML是gpfist协议如何基于之前的模式把Avro数据从clist域转换到XML数据的例子。对于嵌在Avro顶层记录中的记录,gpfist协议把Avro元素名称转换成XML元素名称并且把记录名称转换成该XML元素的一个属性。例如,最顶层元素clist的名称和type属性是Avro记录元素clistRecord的名称。
<clist type="clistRecord">
<class type="string">math</class>
<score type="double">99.5</score>
<grade type="inner2">
<a type="double">88.8</a>
<b type="string">subb0</b>
</grade>
<a type="double">77.7</a>
<b type="string">subb20</b>
<c type="inner3">
<c1 type="string">subc</c1>
<c2 type="int& quot;>0</c2>
</c>
</grade2>
</clist>
在为一个可读外部表指定模式(指定一个Avro文件作为来源)时,Greenplum数据库使用该模式从Avro文件中读取数据。这个指定的模式覆盖Avro文件的模式。
可以把含有一个Avro模式的文件指定为CREATE EXTERNAL TABLE命令中位置参数的一部分,这将会覆盖Avro文件的模式。如果一组Avro文件含有不同的且相关的模式,可以为所有的文件共同指定一个Avro模式来检索数据。
Greenplum数据基于域名称从Avro文件中抽取数据。如果一个Avro文件含同名的域,Greenplum数据库就读出其数据,否则返回一个NULL。
{
"type":"record",
"name":"tav2",
"doc":"",
"fields":[
{"name":"id","type":["null","int"],"doc":""},
{"name":"name","type":["null","string"],"doc":""},
{"name":"age","type":["null","long"],"doc":""},
{"name":"birth","type":["null","string"],"doc":""}
]
}
这是更新后含有一个comment域的模式。
{
"type":"record",
"name":"tav2",
"namespace":"public.avro",
"doc":"",
"fields":[
{"name":"id","type":["null","int"],"doc":""},
{"name":"name","type":["null","string"],"doc":""},
{"name":"birth","type":["null","string"],"doc":""},
{"name":"age","type":["null","long"],"doc":""},
{"name":"comment","type":["null","string"],"doc":""}
]
}
可以在一个CREATE EXTERNAL TABLE命令中指定一个含有该Avro模式的文件来从这些Avro文件读取id、name、birth以及comment域。
在这个示例命令中,顾客数据在Avro文件tmp/cust*.avro中。每个文件都使用前面列举的模式之一。文件avro/cust.avsc是一个文本文件,其中包含的Avro模式用来覆盖顾客文件中的模式。
CREATE WRITABLE EXTERNAL TABLE cust_avro(id int, name text, birth date)
LOCATION ('gphdfs://my_hdfs:8020/tmp/cust*.avro
?schema=hdfs://my_hdfs:8020/avro/cust.avsc')
FORMAT 'avro';
在读取Avro数据时,如果Greenplum数据库读取一个不含有comment域的文件,会为comment数据返回一个NULL。
写Avro文件时的数据转换
在创建一个写数据到一个Avro文件的可写外部表时,每一个表行是一个Avro记录并且每一个表列是一个Avro域。在写一个Avro文件时,默认的压缩算法是deflate。
对于一个可写的外部表,如果没有指定schema选项,Greenplum数据库会根据外部表定义为Avro文件创建一个Avro模式。表列的名称就是Avro域的名称。数据类型是一种联合数据类型,见下面的表:
可以指定一个带有schema选项的模式。在指定一个模式时,该文件可以在Segment主机上或者是Greenplum数据库可访问的HDFS上的一个文件。对于一个本地文件,该文件必须在所有的Segment主机上位于相同的位置。对于一个HDFS上的文件,该文件必须和数据文件位于同一个集群上。
这个schema选项的例子指定了一个HDFS上的模式。
'schema=hdfs://mytest:8000/avro/array_simple.avsc'
这个schema选项的例子指定了一个主机文件系统上的模式。
'schema=file:///mydata/avro_schema/array_simple.avsc'
对于一个Greenplum数据库的可写外部表定义,列不能指定NOT NULL子句。
Greenplum数据库只支持Avro文件中的单一顶层模式,或者用CREATE EXTERNAL TABLE命令中的schema参数指定。如果Greenplum数据库检测到多个顶层模式,则会返回一个错误。
Greenplum数据库不支持Avro的map数据类型并且在遇到时会返回一个错误。
当Greenplum数据库从一个Avro文件读取一个数组时,该数组会被转换成一个字符文本值。例如,数组[1,3]会被转换成’{1,3}’。
支持用户定义的类型(UDT),包括数组UDT。对于一个可写的外部表,该类型会被转换成一个字符串。
例子
从两个Avro域id和ba读取数据的简单CREATE EXTERNAL TABLE命令。
CREATE EXTERNAL TABLE avro1 (id int, ba bytea[])
LOCATION ('gphdfs://my_hdfs:8020/avro/singleAvro/array2.avro')
FORMAT 'avro';
CREATE WRITABLE EXTERNAL TABLE命令指定gphdfs协议用来创建Avro文件的Avro模式。
CREATE WRITABLE EXTERNAL TABLE atudt1 (id int, info myt, birth date, salary numeric )
LOCATION ('gphdfs://my_hdfs:8020/tmp/emp01.avro
FORMAT 'avro';